马克思主义学院前身是北京中医药大学社科部，1957年底成立，时名政治理论课教研组，1986年成立社科部，2003年6月与公共外语部组建文法系。2009年3月，学校独立设置社会科学部二级教学科研机构，与人文学院合署办公。2015年10月，成立马克思主义学院，独立设置二级机构，统一管理思想政治理论课和马克思主义理论学科建设，进行马克思主义理论人才培养。马克思主义学院设有七个教研室分别为：思想道德修养与法律基础教研室、中国近现代史纲要教研室、习近平新时代中国特色社会主义思想概论教研室、马克思主义基本原理教研室、毛泽东思想和中国特色社会主义理论体系教研室、形势与政策教研室、大学生成才与职业发展教研室。

学院现有专任教师40人，院外导师6人，其中教授6人，副教授19人，讲师21人；博士占76.1%，45岁以下教师占到71.3%。拥有教育部“新世纪优秀人才支持计划”1 人，北京市新世纪中青年社科理论人才“百人工程”1 人，北京市思想政治理课特级教师 2 人，北京高等学校青年英才计划 2 人，北京市扬帆资助计划人才 1人，北京市优秀德育工作者 2 人，北京高校优秀党务工作者1人，校级教学名师2 人，校级学术带头人1人。

学院承担全校本科生、研究生思想政治理论课教育教学和马克思主义理论学科建设及专业人才培养任务。面向学校开设共计49门课程，其中本科公共必修课和选修课程27门，硕士生公共课3门，博士生公共必修课1门，马克思主义理论专业课程18门。其中3门思想政治理论课被评为校级精品课程。2018年获批马克思主义理论一级学科硕士学位授权点，下设马克思主义基本原理、马克思主义中国化、思想政治教育三个二级学科。

学院是第二批北京市重点建设马克思主义学院，拥有首批“北京高校思想政治理论课教育教学改革示范点”，是北京高校中国特色社会主义理论研究协同创新中心协同单位，建有北京中医药大学马克思主义中国化研究中心、思想政治教育研究中心、马克思主义与中华优秀传统文化研究中心、党的建设和中医药发展研究中心等四个研究中心，以平台带动特色研究。

2019年以来，随着队伍不断扩大，研究成果增长迅速。教师参与国社科重大项目、特别委托项目，同时立项国社科后期资助、思政专项各1项；教育部规划2项、思政专项3项；团中央课题1项；北京社科基金2项；国家中医药管理局课题1项；北京市中医管理局课题2项；北京市教工委课题5项；北京市协同创新中心横向课题1项。学院出版著作23部，其中主编或者独著13部。发表论文250余篇，CSSCI论文30篇，三报一刊8篇。

在学校党委的统一领导下，在校各职能部门和有关学院的大力支持下，马克思主义学院各方面工作取得了很大进展，师资结构更为合理，教学质量与办学水平逐步提高，学科建设与科研工作明显提升，正日渐成为马克思主义理论教学和研究基地、服务于中医药专门人才和全面参与人类健康事业的复合型人才思想政治素质及人文素养培养的学院。

2023年11月